انیمیشن خیزش لاک پشت های نینجا ، روایتگر داستان های جدید در مورد ۴ لاک پشت شگفت انگیز به نام های میکل آنجلو، لیوناردو،داناتلو و رافایل می باشد که نینجوتسو را از یک موش (استاد اسپلینتر) که مانند خودشان جهش یافته و انسان گون است می آموزند. آن‏‏ها در فاضلاب نیویورک زندگی می کنند و به مبارزه دشمنان خود می روند…